Plusieurs dizaines d'années après la conclusion de Yu-Gi-Oh! GX, le jeu Duel de Monstres a changé; les "Turbo Duels" révolutionnant les duels dans 5D'S. Ces duels sont joués dans des stades géants, et les duellistes font de la moto équipée pour les duels, appelés Duel Runners. Domino City a aussi changé sous la direction du chef des forces de sécurité, Rex Goodwin. De riches et puissantes personnes vivent dans ce qui est maintenant connue comme la Nouvelle Domino City, alors que les plus pauvres ont fuis et vivent principalement dans les bas-fonds connus sous le nom de Satellite. Ils sont appelés les déchets de Satellite par les habitants de Domino City. Un ingénieux duelliste de Satellite, Yusei Fudo, a construit son propre Duel Runner. Mais Jack Atlas, se refuse à être un déchet et rêve de devenir le roi des duels. C'est alors qu'un jour, l'assistant de Rex Goodwin : Lazar, vient proposer à Jack de devenir le roi des duellistes de New Domino City à la seule condition d'avoir comme passeport le Dragon Poussière d'Étoile de Yusei et son propre Dragon Rouge Archdémon. Jack fait un coup-monté à Yusei pour lui prendre son Duel Runner et son Dragon Poussière d'Étoile en se servant d'un de ses amis : Rally Dawson. Il lui dit qu'il a subitement disparu alors que c'est lui qui l'a mis à l'eau sur un bateau gonflable pendant que la mer était agitée. Yusei arrive en Duel Runner, pose son Deck et nage pour sauver Rally tandis que Jack lui vole son dragon ainsi que son runner et s'en va vers son nouveau destin, celui d'être le Roi des Duellistes de New Domino City. Pendant que Jack combat pour devenir le Roi des Duels, Yusei et ses amis sont forcés de vivre à Satellite.
Saison 1
01- Une puce suspecte (excellant)
02- Drôles d'insectes(excellant)
03- Utopie(excellant)
04- Retrouvailles 1ère partie(excellant)
05- Retrouvailles 2ème partie(excellant)
06- Le centre de détention 1ère partie(excellant)
08- Un duel de feu(excellant)
09- Duel au centre de détention 1ère partie(excellant)
10- Duel au centre de détention 2ème partie(excellant)
11- Un runner à retrouver 1ère partie(excellant)
12- Un runner à retrouver 2ème partie(excellant)
13- Un duel mémorable(excellant)
16- Bataille avec la Rose Noire (excellant)
19- Retour au monde des esprits 2ème partie (excellant)
03- Gentil Trudge, méchant Trudge (excellant)
04- La lutte ou la fuite (excellant)
05- Tag duel entre amis (exellant)
06- De sombres Présages 1ère partie (exellant)
07- De sombres présages 2ème partie (excellant)
08- De sombres présages 3ème partie (excellant)
09- De sombres présages 4ème partie (excellant!)
11- Recherche Approfondie 1ère partie (exellant)
13- Recherche approfondie 3ème partie (excellant)
14- L'Affrontement des dragons 1ère partie (excellant)
15- L'Affrontement des dragons 2ème partie (excellant)
19- La marque de l'araignée 1ère partie (excellant)
20- La marque de l'araignée 2ème partie (excellant)
21- La marque du singe 1ère partie (excellant)
24- La marque du singe 4ème partie (excellant)
29- Une affaire à régler Partie 2 (excellant)
31- La force du destin Partie 2 (excellant)
03- Une bonne leçon (excellant)
Saison 4
Perso préféré: Yusei, Crow, Blister
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